VSE knjižnice (vzajemna bibliografsko-kataložna baza podatkov COBIB.SI)
  • Izolacija in karakterizacija gena za bifunkcionalni citokrom P450 iz glive Rhizopus igricans = Isolation and characterisation of a gene encoding a self-sufficient cytochrome P450 from the fungus Rhizopus nigricans : diplomska naloga
    Gašparović, Adrijana
    Zigomicetna filamentozna gliva Rhizopus nigricans je mikroorganizem, ki z razlièno uèinkovitostjo hidroksilira progesteron, deoksikortikosteron in testosteron. Steroidi najverjetneje predstavljajo za ... to glivo ksenobiotike in inducirajo hidroksilazni sistem, s katerim se pretvorijo v bolj hidrofilne produkte, ki se nato izloèijo iz organizma. Pri hidroksilaciji je udelezen kotkonèna monooksigenaza citokrom P450. Glede na to, da geni za citokrome P450pri glivah iz debla Zygomycota se niso bili izolirani in analizirani, smo se z delom usmerili v preuèevanje enega od genov za te encime. Izhodisèe za delo je bil fragment cDNA glive R. nigricans z analiziranim nukleotidnim zaporedjem, najverjetneje z zapisom za del bifunkcionalnega citokroma P450. Z metodo PCR in zaèetnima oligonukleotidoma, od katerih je bil eden komplementaren fragmentu cDNA glive R. nigricans in drugi sintetiziran na osnovi dveh genov za bifunkcionalna citokroma P450 glive R. oryzae, smo pomnozili fragment genomske DNA in ga klonirali v vektor pGEM -T Easy. Po pomnozitvi rekombinantnega vektorja v gostiteljskih bakterijskih celicah, smo fragmentu genomske DNA doloèili nukleotidno zaporedje. Nukleotidno zaporedje dolgo 2108 bp smo primerjali z nukleotidnim zaporedjem ze izoliranega fragmenta cDNA in iz obeh sestavili fragment dolg 2873 bp. Fragment DNA smo prevedli v 957 aminokislin dolgo zaporedje in ga primerjali z aminokislinskimizaporedji bifunkcionalnih citokromov P450 iz drugih organizmovter narisali filogenetsko drevo. Rezultati primerjav so pokazali, daima bifunkcionalni citokrom P450 glive R. nigricans najveèji odstotek (86%) identiènih aminokislin s hipotetiènim bifunkcionalnim citokromom P450 (encimomB) sorodne glive R. oryzae in v filogenetskem drevesu tvori skupino z encimoma A in B te glive, medtem ko tvorijo drugo skupino bifunkcionalni citokromi P450 bakterije Bacillus megaterium in treh askomicetnih gliv Fusarium oxysporum, Aspergillus oryzae in Giberella zeae. Nadalje smo na osnovi primerjav lahko sklepali, da izoliranemu genu za bifunkcionalni citokrom P450 glive R. nigricans najverjetneje manjkata zapisa za priblizno 200 aminokislin na 5 koncu in na 3 koncu za okoli 40 aminokislin. V aminokislinskem zaporedju bifunkcionalnega citokroma P450 glive R. nigricans smo tudi identificirali vsa aminokislinska zaporedja, ki so ohranjena v I-in K-heliksu ter hem-vezavnem podroèju citokromov P450, kot tudi ohranjena podroèja, kamor se v njihovih reduktazah vezejo kofaktorji FAD, FMN in NAD(P)H.
    Vrsta gradiva - diplomsko delo ; neleposlovje za odrasle
    Založništvo in izdelava - Ljubljana : [Gašparović, A.], 2006
    Jezik - slovenski
    COBISS.SI-ID - 1972081

Knjižnica/institucija Kraj Akronim Za izposojo Druga zaloga
Fakulteta za farmacijo, Ljubljana Ljubljana FFALJ v čitalnico 1 izv.
loading ...
loading ...
loading ...

Vnos na polico